15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1252 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1868  hypothetical protein  55.33 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  26.58 
 
 
254 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  30.3 
 
 
795 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4632  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4720  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5014  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2613  hypothetical protein  24.2 
 
 
246 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5218  hypothetical protein  27.97 
 
 
246 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1540  hypothetical protein  31.03 
 
 
254 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1360  hypothetical protein  27.52 
 
 
245 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13552  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00218816  hitchhiker  0.00000199189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4103  hypothetical protein  26.44 
 
 
238 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.706455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2527  Acetoacetate decarboxylase  29.05 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3220  hypothetical protein  28.46 
 
 
350 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111198  normal  0.590699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>