13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1630 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1630  thiW protein  100 
 
 
181 aa  359  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.492516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0937  hypothetical protein  38.55 
 
 
169 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0835  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.768016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0568  thiW protein  36.73 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000229686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2485  thiW protein  32.1 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0862  hypothetical protein  34.29 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2442  thiW protein  36.43 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0147282  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1354  hypothetical protein  30.72 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.350585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1380  hypothetical protein  30.72 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1925  thiW protein  39.6 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4123  thiW protein  38.61 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1712  thiW protein  29.22 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2789  ThiW  27.13 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>