12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0032 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0032  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  637    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2121  hypothetical protein  21.69 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0895  hypothetical protein  43.9 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1344  hypothetical protein  38.89 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2111  hypothetical protein  44.83 
 
 		 63 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  41.67 
 
 		 570 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1130  hypothetical protein  38.46 
 
 		 175 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.659523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5367  hypothetical protein  48.15 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.128779  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2573  hypothetical protein  40.3 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.298255  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8546  hypothetical protein  46.3 
 
 		 233 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000672005  hitchhiker  0.000280584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0865  hypothetical protein  39.68 
 
 		 114 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1305  hypothetical protein  28.85 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>