13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0998 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  26.72 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  28.87 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3052  hypothetical protein  28.1 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  26.8 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3251  hypothetical protein  25.62 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.072777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  28.71 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  29.03 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3150  hypothetical protein  26.09 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  29.55 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  27.17 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>