34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6998 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  186  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1922  hypothetical protein  51.52 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0723  hypothetical protein  39.71 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  45.9 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  48 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  45.28 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3972  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0855502  normal  0.350768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  48.72 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  40.58 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  42.22 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  43.18 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  36.54 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>