23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3972 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3972  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0855502  normal  0.350768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0723  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1922  hypothetical protein  64.71 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  42.19 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  51.79 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  36.92 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  36.92 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  34.43 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  51.35 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4609  hypothetical protein  39.13 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>