23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4908 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4908  putative lantibiotic modification protein  100 
 
 
568 aa  1074    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  29.42 
 
 
1058 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  25.51 
 
 
1040 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  28.04 
 
 
1080 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  29.03 
 
 
1088 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3731  Lanthionine synthetase C family protein  34.11 
 
 
1012 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.760247 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  24.17 
 
 
989 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  26.91 
 
 
1129 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0349  lanthionine synthetase C family protein  35.68 
 
 
996 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  30.79 
 
 
1093 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  23.95 
 
 
1078 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  23.53 
 
 
1078 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  25.32 
 
 
1117 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  26.45 
 
 
1126 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3738  lanthionine synthetase C-like  28.6 
 
 
611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4441  Lanthionine synthetase C family protein  30.25 
 
 
959 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.385219 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1651  lantibiotic modifying enzyme  29.85 
 
 
1033 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5313  Lanthionine synthetase C family protein  33.69 
 
 
1013 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0569792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  27.62 
 
 
1074 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6089  lanthionine synthetase C family protein  27.05 
 
 
973 aa  97.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21071  MrsD-like protein  25.28 
 
 
1068 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.365739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  26.28 
 
 
756 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09700  lantibiotic modifying enzyme  21.11 
 
 
610 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>