61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2636 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 		 262 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50.36 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  51.48 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  51.48 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.63 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  47.25 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.26 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.13 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.96 
 
 		 310 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.6 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  47.48 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.17 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.39 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.49 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  46.35 
 
 		 292 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.68 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  39.63 
 
 		 1139 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6669  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  30.77 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.27 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2230  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.73 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.6 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0849  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.93 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.07 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  26.96 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1489  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  31.19 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.63 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  28.86 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  20.97 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.38 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  43.42 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4414  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.47 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.939465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2053  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  24.26 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  26.64 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5889  carbon-monoxide dehydrogenase  25.2 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0466887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0171  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  29.08 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0841  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.41 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  hitchhiker  0.00000381307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.3 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.08 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  24.35 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.92 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10380  carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit  28.18 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.65 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0510  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.71 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4506  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  35.87 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2855  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.08 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.200412 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  26.02 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.96 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  30 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0478  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.63 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0500  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.63 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0489  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.63 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.67 
 
 		 496 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0342  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 288 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>