17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2516 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  60.95 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  53.55 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  47.18 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  48.57 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  46.43 
 
 		 190 aa  157  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  46.56 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  45.45 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  45.71 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  45.31 
 
 		 205 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  43.26 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  46.2 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  45.56 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  40.21 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  45.12 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  23.57 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2920  DoxX  22.7 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0222503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>