12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2230 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2230  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0675867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  52.22 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  44.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  34.01 
 
 		 1889 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.660291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  52.11 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4422  hypothetical protein  54.84 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  29.13 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  25.93 
 
 		 3242 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0806  FHA domain-containing protein  46.91 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  47.83 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24120  hypothetical protein  56 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3438  hypothetical protein  29.32 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>