14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1986 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1986  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  233  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3871  hypothetical protein  60.34 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6461  hypothetical protein  56.78 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0667  hypothetical protein  27.5 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000134127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4318  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1110  hypothetical protein  30.95 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3385  hypothetical protein  33.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3449  hypothetical protein  33.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0939  hypothetical protein  25.41 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2876  Protein of unknown function DUF2203  29.52 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.957585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0290  hypothetical protein  30.83 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.874354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3367  hypothetical protein  39.66 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.75598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0783  hypothetical protein  24.66 
 
 		 121 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.690616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>