22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0886 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 955 aa  1914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07280  hypothetical protein  80.9 
 
 		 980 aa  1516    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0484  hypothetical protein  39.1 
 
 		 1201 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0181373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4299  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1056 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.511127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4735  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1114 aa  499  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000107106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0639  hypothetical protein  37.42 
 
 		 920 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  25.88 
 
 		 821 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  26.74 
 
 		 823 aa  193  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  25.23 
 
 		 827 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  25.71 
 
 		 816 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  26.21 
 
 		 830 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1167  hypothetical protein  29.44 
 
 		 826 aa  90.1  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  25.23 
 
 		 819 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.86 
 
 		 802 aa  88.2  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.45 
 
 		 802 aa  86.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  22.5 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  24.15 
 
 		 807 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  23.97 
 
 		 805 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5943  hypothetical protein  25.22 
 
 		 832 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5541  hypothetical protein  25.22 
 
 		 832 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696223 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  23.35 
 
 		 856 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  23.33 
 
 		 846 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>