110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1975 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1975    100 
 
 
840 bp  1665    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32590    81.38 
 
 
624 bp  196  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0083  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  97.83 
 
 
1221 bp  83.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1291  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  97.83 
 
 
1221 bp  83.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0338  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  97.83 
 
 
1221 bp  83.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.913809  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2573  ISRSO15-transposase protein  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1547  ISRSO15-transposase protein  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.355973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2438  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0150  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.116574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1439  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  93.48 
 
 
1221 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0319    91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0443    91.3 
 
 
1023 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1016  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1230  ISBma1, transposase, interruption-N  91.3 
 
 
768 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1512  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1863  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1934  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2090  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2594    91.3 
 
 
807 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3241  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0176    91.3 
 
 
1164 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1213  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1461  transposase  91.3 
 
 
525 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3515    91.3 
 
 
1122 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3471  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0465  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1656  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0734  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0916  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1535  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
726 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2078  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.64027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3118  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000303493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3162  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0180  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.017513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1101  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1347    91.3 
 
 
1164 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0613  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
741 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1019  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1099  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1716    91.3 
 
 
768 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2011  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2588    91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2619  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1062 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3132    91.3 
 
 
1122 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3176  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3524  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1122 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0456  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321597  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1544    91.3 
 
 
1164 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0373    91.3 
 
 
768 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0767  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0991  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1917  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00988303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1961    91.3 
 
 
1122 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.96725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2265  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2448  transposase  91.3 
 
 
741 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3299  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1161 bp  60  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0202    91.3 
 
 
1164 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00497899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1119  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2202  isrso15-transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0061    91.3 
 
 
741 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0156  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0382  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0788    91.3 
 
 
768 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1283  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  91.3 
 
 
1221 bp  60  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6812  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  89.8 
 
 
1221 bp  58  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  90.24 
 
 
1224 bp  50.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  96.55 
 
 
2544 bp  50.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0323  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
1224 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00100796  hitchhiker  0.000174276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0443  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
1224 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0800  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
1224 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1185  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
1095 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>