26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0208 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 
89 aa  184  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  84.27 
 
 
89 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  82.02 
 
 
89 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  82.02 
 
 
89 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  83.15 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  79.78 
 
 
89 aa  150  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  69.66 
 
 
89 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  67.42 
 
 
89 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  64.04 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.18 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  58.62 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.22 
 
 
90 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  52.38 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  52.94 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.38 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  48.78 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  43.02 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  39.29 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  27.71 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  32 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  32 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  28.05 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  33.33 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  27.4 
 
 
146 aa  40  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1595  toluene-4-monooxygenase system protein D  30.56 
 
 
99 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>