23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1634 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1165    85.92 
 
 
905 bp  682    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    100 
 
 
1113 bp  2206    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1654  hypothetical protein  85.95 
 
 
1023 bp  718    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.696062  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    83.51 
 
 
3611 bp  615  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    83.51 
 
 
1291 bp  615  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1655  hypothetical protein  90.98 
 
 
270 bp  155  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.549221  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1312    80.8 
 
 
965 bp  135  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.293835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0547    82.69 
 
 
420 bp  135  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  96.77 
 
 
1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  96.77 
 
 
1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  96.77 
 
 
1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    86.57 
 
 
1271 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  96.77 
 
 
1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1530    94.12 
 
 
3230 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1491    94.12 
 
 
1217 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0567673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  94.12 
 
 
1218 bp  52  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    96.55 
 
 
1213 bp  50.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>