13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0768 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 167 aa  310  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  32.62 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  36.78 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  31.85 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0532  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  32.39 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  32.18 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  36.96 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  36.78 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  43.33 
 
 		 193 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>