14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0547 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0547    100 
 
 
420 bp  833    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1312    88.36 
 
 
965 bp  184  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.293835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    82.69 
 
 
1113 bp  135  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    84.57 
 
 
3611 bp  135  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    84.57 
 
 
1291 bp  135  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1655  hypothetical protein  84.32 
 
 
270 bp  129  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.549221  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1165    93.62 
 
 
905 bp  61.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1654  hypothetical protein  84.42 
 
 
1023 bp  58  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.696062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  94.29 
 
 
1233 bp  54  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  94.29 
 
 
1233 bp  54  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  94.29 
 
 
1233 bp  54  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  94.29 
 
 
1233 bp  54  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    91.67 
 
 
1271 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    91.43 
 
 
1213 bp  46.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>