31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0179 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0179  thiamineS protein  100 
 
 
83 aa  154  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0016  MoaD family protein  38.04 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.767605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
223 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1889  MoaD family protein  35.37 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0225  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.49 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000241588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0202  thiamineS protein  36.25 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.937205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.82 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0334  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.53 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4187  MoaD family protein  29.27 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.53 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4226  MoaD family protein  29.27 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139211  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.21 
 
 
85 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.67 
 
 
85 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.05 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.21 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.05 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
217 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0159  thiamineS protein  33.73 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.67 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.21 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3329  MoaD family protein  32.93 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.05 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.05 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
217 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>