19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0814 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0814  LigA  100 
 
 
557 aa  1095    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  94.28 
 
 
542 aa  989    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  94.66 
 
 
544 aa  993    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  36.25 
 
 
535 aa  56.6  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  29.76 
 
 
410 aa  55.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  37.8 
 
 
418 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  38.71 
 
 
408 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  36.96 
 
 
265 aa  50.8  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  27.94 
 
 
411 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  34.74 
 
 
412 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  34.09 
 
 
484 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  34.15 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  35.56 
 
 
457 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  36.36 
 
 
457 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  34.07 
 
 
411 aa  47  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  25.66 
 
 
791 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  32.79 
 
 
313 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  31.18 
 
 
423 aa  43.9  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  31.82 
 
 
404 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>