More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0024 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0197077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0032  tRNA-Ala  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0033  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0012  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00270892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0069  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  96 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  96 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_003295  RS05733  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746893  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1339  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0927  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000140839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0072  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000111766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0003  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000376598  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0009  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275815  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0014  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0217689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0052  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000131419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0062  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0072  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>