14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2089 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2089  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  671    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.15 
 
 
391 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0085  hypothetical protein  41.09 
 
 
376 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  44.48 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  31.6 
 
 
217 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  30.19 
 
 
214 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.1 
 
 
221 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  29.56 
 
 
211 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  28.49 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  27.98 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  30.05 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  29.89 
 
 
251 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  27.34 
 
 
186 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>