144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0404 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  100 
 
 		 187 aa  356  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  35.45 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  37.13 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  32.29 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  36.17 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  39.35 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  37.25 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  33.52 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  32.78 
 
 		 208 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  34.84 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  34.44 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  30.43 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  33.16 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  35.48 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  34.22 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  35.1 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  34.88 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  31.88 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  31.12 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  40 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  34.24 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  34.73 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  37.27 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  36.81 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  36.42 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  34.52 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  37.02 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4630  Colicin V production protein  34.51 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  34.36 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  35.33 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  31.17 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  34.36 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  34.36 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  34.36 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1711  colicin V production protein  39.37 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  34.36 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  32.3 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  34.36 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  33.33 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  35.33 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  35.33 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  35.33 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  29.69 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  34.29 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  30.37 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  35.76 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  34.57 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  34.57 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  35.76 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  33.75 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  29.79 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  33.74 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  33.74 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  31.87 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  33.74 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  33.74 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  33.74 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  33.74 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  32.26 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  29.94 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  32.7 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  30.63 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  29.79 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  29.26 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  32.08 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  29.26 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  33.74 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  29.79 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  37.41 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  31.45 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  34.19 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  32.52 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  34.51 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  31.28 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  32.7 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  31.45 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  29.27 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1785  colicin V production protein  35.11 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.170102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  31.82 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.63 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  34.78 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  37.82 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  30.82 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  27.71 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  27.71 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  32.58 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  35.37 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  30.3 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1206  colicin V production protein  39.81 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  33.33 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  33.33 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  28.09 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>