25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0085 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_R0085  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  86.36 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  85.29 
 
 
73 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  85.29 
 
 
73 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  85.29 
 
 
73 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0056  tRNA-Glu  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000501155  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08680  tRNA-Glu  84.51 
 
 
76 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0046  tRNA-Glu  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0048  tRNA-Glu  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  83.82 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  84.38 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  83.82 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08670  tRNA-Glu  83.1 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  82.43 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  82.43 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  82.43 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>