14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0930 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0930  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  763    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  29.54 
 
 
381 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  29.84 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  30.72 
 
 
357 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0385  hypothetical protein  32.39 
 
 
384 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01680  hypothetical protein  28.07 
 
 
396 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.607562  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4840  hypothetical protein  27.49 
 
 
367 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1207  hypothetical protein  28.45 
 
 
392 aa  87  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.556738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  26.32 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0752  hypothetical protein  25.34 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  25.52 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6299  hypothetical protein  23.35 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.57 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5741  hypothetical protein  23.81 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>