32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0865 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  54.74 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  52.43 
 
 
209 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  48.13 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  47.8 
 
 
205 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  47.8 
 
 
205 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  47.59 
 
 
205 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  53.26 
 
 
209 aa  144  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  47.34 
 
 
210 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  41.34 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  45 
 
 
206 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  44.68 
 
 
220 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  42.11 
 
 
248 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  42.56 
 
 
220 aa  128  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  43.24 
 
 
238 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  42.11 
 
 
214 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  40.95 
 
 
240 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  42.02 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  42.54 
 
 
210 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  41.67 
 
 
207 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  39.89 
 
 
210 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  40.56 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  44.38 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  45.45 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  43.64 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  104  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  44.1 
 
 
210 aa  99  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  38.97 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  35.6 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.95 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  32.7 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  40.26 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>