299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0064 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0064  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.373773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0015  tRNA-Glu  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0053  tRNA-Glu  93.88 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000216917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  95.45 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00045  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0997281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00078  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00645399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0097  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4223  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4102  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4173  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00665107  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2874  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.403763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2853  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0537203  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4117  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0976755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4389  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  0.7898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0086  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0185874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5193  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411185  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0060  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0296657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3830  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00526178  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3699  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0040697  normal  0.0437365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4512  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00641389  normal  0.576073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2769  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00441704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0087  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000979813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3591  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000586916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2987  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4423  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4282  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4586  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000616309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5433  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000105127  normal  0.0151681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5478  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00757172  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0079  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0021  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00556974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0099  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0389397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0094  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0032  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0099  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000015218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4510  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0115463  normal  0.0174598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4465  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000990931  hitchhiker  0.00000000000884096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  93.33 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>