13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2084 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2084  TM2 domain containing protein  100 
 
 
76 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0744  TM2  44.78 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1715  TM2  47.14 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.67624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1809  TM2  44.78 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  48.48 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1791  TM2  36.99 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0956269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1932  TM2 domain containing protein  34.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.533409  normal  0.0149218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1604  TM2 domain containing protein  34.67 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.345673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  38.57 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1614  hypothetical protein  35.14 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696869  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  32.79 
 
 
305 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>