16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03720 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03720  Protein transport protein sec24 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6W0]  100 
 
 		 908 aa  1862    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00260  ER to Golgi transport-related protein, putative  54.87 
 
 		 920 aa  812    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00276078  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88354  SED5-binding protein 2 (SEC24-related protein 2) component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  46.7 
 
 		 907 aa  810    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88822  predicted protein  38.87 
 
 		 774 aa  492  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  decreased coverage  0.00889443 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13396  predicted protein  40.42 
 
 		 680 aa  479  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03080  vesicle coat complex COPII, subunit Sec24 family protein, putative (Eurofung)  30.8 
 
 		 1031 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0488022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44386  predicted protein  33.11 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.704659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81443  sec-24-like membrane protein involved in ER to Golgi vesicular transport  28.3 
 
 		 939 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.181556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01000  ER to Golgi transport-related protein, putative  27.38 
 
 		 1003 aa  233  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779666  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48220  predicted protein  23.6 
 
 		 1041 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313872  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24928  predicted protein  21.84 
 
 		 824 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.490634 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33543  predicted protein  28.12 
 
 		 771 aa  48.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336143  normal  0.164519 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76723  predicted protein  29.63 
 
 		 816 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322437 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16541  predicted protein  22.09 
 
 		 770 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.700638  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80516  component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  19.64 
 
 		 749 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.461247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01150  hypothetical protein  21.65 
 
 		 763 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.966337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>