205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2906 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  100 
 
 		 328 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  42.12 
 
 		 312 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1675  protein of unknown function DUF403  43.18 
 
 		 315 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  41.04 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  42.39 
 
 		 311 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  41.99 
 
 		 312 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  40.51 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0398  hypothetical protein  41.29 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3100  hypothetical protein  37.58 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.154956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  34.39 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  33.44 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  33.23 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  33.12 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  33.75 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0989  hypothetical protein  34.84 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  34.8 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  31.95 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  30.7 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  30.7 
 
 		 321 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  33.79 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  30.6 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  35.02 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  31.48 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  28.57 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  33.77 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  28.62 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  27.68 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  29.19 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  30.79 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  30.48 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  33.71 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  27.64 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  31.25 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  30.48 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  30.48 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  33.44 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  33.44 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  34.55 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  31.35 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  31.35 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  33.44 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  30.59 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  32.24 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  33.45 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  30.48 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  31.37 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  32.2 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  31.29 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  32.34 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  32.34 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  32.33 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  30.48 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  32.28 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  33 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  31.89 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  31.63 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  31.89 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  31.89 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  29.84 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  31.21 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  32.78 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  31.87 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  31.37 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  33.1 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  31.06 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  31.97 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  31.5 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  31.31 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  32.27 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  30.5 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  32.57 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  31.76 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  32.65 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  29.25 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  31.45 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  31.01 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  30.46 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  32.13 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  32.91 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  31.56 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  32.95 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  32.96 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>