23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0866 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  100 
 
 		 542 aa  1063    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  94.28 
 
 		 557 aa  989    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  99.26 
 
 		 544 aa  1054    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  35 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  37.8 
 
 		 418 aa  53.5  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  38.04 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  30.29 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  25.76 
 
 		 457 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  34.15 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  32.95 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  36.14 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  25.66 
 
 		 791 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  33.33 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  32.93 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  32.97 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  37 
 
 		 459 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2908  hypothetical protein  29.13 
 
 		 302 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  32.79 
 
 		 313 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  31.18 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  26.32 
 
 		 404 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  32.04 
 
 		 461 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  32.04 
 
 		 461 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>