13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0560 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0531  hypothetical protein  91.4 
 
 		 605 aa  890    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0563  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  96.86 
 
 		 605 aa  951    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0560  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  100 
 
 		 605 aa  1174    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2994  Patatin  40 
 
 		 666 aa  297  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2024  patatin  38.13 
 
 		 631 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  38.31 
 
 		 624 aa  280  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1993  putative suppressor  33.84 
 
 		 630 aa  247  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  33.57 
 
 		 685 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1013  hypothetical protein  37.97 
 
 		 782 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3069  hypothetical protein  38.9 
 
 		 782 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5875  Patatin  38.76 
 
 		 646 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  27.66 
 
 		 341 aa  47  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  59.09 
 
 		 332 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>