15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pisl_0205  CDS  NC_008701  194309  195508  1200  hydrogenase formation HypD protein  YP_929730  unclonable  7.49019e-08  normal  0.0529868  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0206  CDS  NC_008701  195510  195857  348  hypothetical protein  YP_929731  unclonable  5.27651e-09  normal  0.0573438  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0474  CDS  NC_008701  445354  446358  1005  inner-membrane translocator  YP_929995  unclonable  1.32511e-07  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0624  CDS  NC_008701  572542  572772  231  hypothetical protein  YP_930145  unclonable  1.36501e-08  hitchhiker  1.47655e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0625  CDS  NC_008701  572797  574569  1773  putative ATPase RIL  YP_930146  unclonable  1.79458e-06  hitchhiker  2.08503e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0626  CDS  NC_008701  574572  575039  468  hypothetical protein  YP_930147  unclonable  1.62031e-08  hitchhiker  4.57675e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0627  CDS  NC_008701  575032  575487  456  hypothetical protein  YP_930148  unclonable  1.60341e-08  hitchhiker  4.30067e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0628  CDS  NC_008701  575469  576095  627  hypothetical protein  YP_930149  unclonable  2.61982e-08  hitchhiker  3.4229e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0638  CDS  NC_008701  582204  583850  1647  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_930159  unclonable  1.18865e-06  hitchhiker  7.0168e-05  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1024  CDS  NC_008701  923999  925210  1212  FAD dependent oxidoreductase  YP_930541  decreased coverage  3.24501e-05  unclonable  1.04901e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1025  CDS  NC_008701  925207  925374  168  hypothetical protein  YP_930542  decreased coverage  1.52486e-06  unclonable  2.33838e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1026  CDS  NC_008701  925430  926578  1149  succinyl-CoA synthetase subunit beta  YP_930543  decreased coverage  2.27763e-05  unclonable  8.1657e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1245  CDS  NC_008701  1129330  1133043  3714  reverse gyrase  YP_930753  unclonable  0.000744005  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1506  CDS  NC_008701  1374604  1375911  1308  sulfatase  YP_931005  unclonable  5.3867e-07  normal  0.747943  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_1507  CDS  NC_008701  1376110  1376295  186  hypothetical protein  YP_931006  unclonable  1.39327e-08  normal  0.569122  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>