18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcen2424_0920  CDS  NC_008542  1028847  1029791  945  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_834566  unclonable  1.71601e-11  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_1288  CDS  NC_008542  1415473  1417050  1578  lytic transglycosylase, catalytic  YP_834933  unclonable  4.51956e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_1321  CDS  NC_008542  1453012  1454283  1272  RelA/SpoT domain-containing protein  YP_834966  unclonable  1.80036e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_2520  CDS  NC_008542  2792692  2792895  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_836163  unclonable  1.51269e-13  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_3153  CDS  NC_008542  3473574  3473987  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_836794  unclonable  1.0528e-12  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4933  CDS  NC_008543  1932186  1939226  7041  outer membrane autotransporter  YP_838560  normal  0.348524  unclonable  0.000124828  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4934  CDS  NC_008543  1939587  1939832  246  hypothetical protein  YP_838561  normal  0.0136868  unclonable  1.82876e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4935  CDS  NC_008543  1940001  1940693  693  hypothetical protein  YP_838562  normal  unclonable  1.88472e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4936  CDS  NC_008543  1940861  1941895  1035  rod shape-determining protein MreB  YP_838563  normal  unclonable  1.94239e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4937  CDS  NC_008543  1942167  1944578  2412  patatin  YP_838564  normal  unclonable  2.95709e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4938  CDS  NC_008543  1944678  1945808  1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_838565  normal  unclonable  1.79203e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4939  CDS  NC_008543  1945873  1946601  729  two component transcriptional regulator  YP_838566  normal  0.795324  unclonable  1.73858e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4940  CDS  NC_008543  1946803  1947717  915  glutaminase  YP_838567  normal  unclonable  1.8103e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4941  CDS  NC_008543  1947951  1948856  906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_838568  normal  0.89804  unclonable  1.94239e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4942  CDS  NC_008543  1949386  1949760  375  hypothetical protein  YP_838569  normal  0.140936  unclonable  1.58871e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_4943  CDS  NC_008543  1949898  1950380  483  cupin 2 domain-containing protein  YP_838570  normal  0.637992  unclonable  1.73858e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_R0031  tRNA  NC_008542  1210435  1210510  76  tRNA-Asn    unclonable  4.20525e-14  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_R0032  tRNA  NC_008542  1210583  1210658  76  tRNA-Asn    unclonable  3.99959e-14  n/a    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>