22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1484 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1484  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  293  7e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  95.95 
 
 
148 aa  248  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1174  hypothetical protein  70.27 
 
 
134 aa  164  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0179647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1271  hypothetical protein  72.3 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0373  hypothetical protein  64.19 
 
 
102 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0766  hypothetical protein  55.41 
 
 
104 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.704694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1376  hypothetical protein  43.71 
 
 
128 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0679  hypothetical protein  69.51 
 
 
191 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0426  hypothetical protein  54.05 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1828  hypothetical protein  47.65 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  45.21 
 
 
278 aa  67  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0532  bacteriophage terminase large (ATPase) subunit and inactivated derivatives-like protein  58.21 
 
 
291 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4448  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  37.97 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528485  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0670  hypothetical protein  27.95 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217425  decreased coverage  0.0000800314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  45.61 
 
 
229 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  44 
 
 
334 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4585  hypothetical protein  31.43 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0352075  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  42.65 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0067  hypothetical protein  26.51 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0521488 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  32.14 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1116  hypothetical protein  35.71 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00693597  normal  0.677465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1451  hypothetical protein  30.25 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000234748  normal  0.258105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>