56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4147 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.28 
 
 
146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2489  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.38 
 
 
148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0248  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.79 
 
 
146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1935  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.45 
 
 
141 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00196313  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5785  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.72 
 
 
145 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932614  normal  0.0358814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.7 
 
 
144 aa  140  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6081  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.63 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1674  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.75 
 
 
150 aa  137  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.98 
 
 
158 aa  135  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3522  hypothetical protein  50.34 
 
 
150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1622  hypothetical protein  51.37 
 
 
151 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1931  hypothetical protein  51.37 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.269466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1882  hypothetical protein  51.37 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.7 
 
 
141 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1648  methylmalonyl-CoA epimerase  49.66 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1856  hypothetical protein  50.68 
 
 
151 aa  133  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.32929e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1810  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.281352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1675  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2554  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
151 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2383  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.9 
 
 
150 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611543  normal  0.517955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  44.76 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  45.45 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.76 
 
 
145 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.9 
 
 
151 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4748  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.26 
 
 
145 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.36 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1910  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.25 
 
 
145 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2063  hypothetical protein  45.05 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.93 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2970  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.14 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495253  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1820  hypothetical protein  60.47 
 
 
45 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  27.46 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  27.59 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  27.59 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  26.76 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  26.76 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.39 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  27.59 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  27.59 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  27.59 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  27.59 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  27.59 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  26.9 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.39 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4078  hypothetical protein  25.19 
 
 
277 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.58 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  25.87 
 
 
127 aa  40  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  24.66 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>