More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3822 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3822  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.86 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0292  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0348953  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3185  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.497846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.71 
 
 
316 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2763  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.08 
 
 
316 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0660856  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2502  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  0.030374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1946  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0175494  decreased coverage  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1512  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1394  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1115  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840923  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0634  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2605  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.978061  normal  0.958241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3229  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4264  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.76 
 
 
316 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2020  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.35 
 
 
316 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00925904  normal  0.0355962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.62 
 
 
316 aa  487  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0974  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.83 
 
 
284 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074599  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
318 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.41 
 
 
322 aa  313  2e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.41 
 
 
322 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
321 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
321 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
321 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
321 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  52.2 
 
 
321 aa  307  1e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  52.2 
 
 
321 aa  307  1e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
321 aa  307  1e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
321 aa  307  1e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.89 
 
 
321 aa  303  4e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.89 
 
 
321 aa  302  4e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.89 
 
 
321 aa  302  4e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.89 
 
 
321 aa  302  4e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.89 
 
 
321 aa  302  4e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.61 
 
 
320 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.61 
 
 
320 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.61 
 
 
320 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.61 
 
 
320 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.61 
 
 
320 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.61 
 
 
320 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.92 
 
 
320 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.92 
 
 
320 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0067  IS110 family transposase  50.16 
 
 
323 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0110214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.92 
 
 
320 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.92 
 
 
320 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.92 
 
 
320 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.92 
 
 
320 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
314 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
314 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.9 
 
 
314 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.9 
 
 
314 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.03 
 
 
318 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  46.2 
 
 
328 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  46.2 
 
 
328 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.59 
 
 
309 aa  234  1e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.59 
 
 
309 aa  234  1e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.27 
 
 
309 aa  232  7e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.27 
 
 
309 aa  232  7e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.1 
 
 
316 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.63 
 
 
315 aa  223  5e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.63 
 
 
315 aa  223  5e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.63 
 
 
315 aa  223  5e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4131  IS111A/IS1328/IS1533  43.14 
 
 
309 aa  218  8e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0485642  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.87 
 
 
315 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.87 
 
 
315 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.87 
 
 
315 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.87 
 
 
315 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.87 
 
 
315 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  44.01 
 
 
315 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  44.01 
 
 
315 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  44.01 
 
 
315 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  43.69 
 
 
315 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4670  transposase IS110 family protein  43.37 
 
 
315 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.2 
 
 
316 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.2 
 
 
316 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.2 
 
 
316 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.2 
 
 
316 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.2 
 
 
316 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.2 
 
 
316 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  39.51 
 
 
320 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>