More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2534 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
271 aa  544  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2874  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.03 
 
 
271 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.93 
 
 
275 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2087  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  79.69 
 
 
276 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228254  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.07 
 
 
270 aa  394  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3224  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.38 
 
 
277 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0991  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.24 
 
 
277 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1075  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.24 
 
 
277 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.786743  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2763  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.87 
 
 
287 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.323857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.04 
 
 
264 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.04 
 
 
277 aa  341  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.01 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.02 
 
 
276 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.33 
 
 
300 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.3 
 
 
270 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.98 
 
 
300 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.19 
 
 
301 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.51 
 
 
301 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.52 
 
 
296 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
296 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
296 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
296 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
296 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
296 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
296 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.17 
 
 
301 aa  294  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.89 
 
 
296 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.18 
 
 
296 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.18 
 
 
296 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.26 
 
 
296 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.11 
 
 
261 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.26 
 
 
298 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.92 
 
 
296 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.92 
 
 
296 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.14 
 
 
289 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.33 
 
 
283 aa  281  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.31 
 
 
263 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.2 
 
 
262 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0834  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.96 
 
 
297 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.17 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.25 
 
 
261 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.83 
 
 
289 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.48 
 
 
287 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.44 
 
 
287 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
283 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.42 
 
 
290 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.73 
 
 
266 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.73 
 
 
266 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
273 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
290 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
290 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.92 
 
 
269 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
290 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
273 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.73 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.26 
 
 
290 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.55 
 
 
268 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.55 
 
 
268 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
256 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
268 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
271 aa  256  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.37 
 
 
266 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.73 
 
 
280 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.3 
 
 
271 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
262 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.27 
 
 
270 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
291 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
261 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
265 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
261 aa  248  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
287 aa  248  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.27 
 
 
268 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
285 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.25 
 
 
270 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.5 
 
 
291 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.5 
 
 
291 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.5 
 
 
291 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.71 
 
 
265 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
291 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
291 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.34 
 
 
290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.93 
 
 
266 aa  241  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.27 
 
 
269 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
268 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
268 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.11 
 
 
268 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.91 
 
 
269 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.91 
 
 
269 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.9 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>