More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0150 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  100 
 
 
255 aa  529  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3978  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1169  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  53.36 
 
 
310 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 
265 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 
286 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  294  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
264 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  52.96 
 
 
265 aa  294  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 
265 aa  294  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 
265 aa  294  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  52.96 
 
 
265 aa  294  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
264 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
264 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  53.75 
 
 
265 aa  293  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  52.57 
 
 
265 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 
265 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  292  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
265 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  52.76 
 
 
255 aa  284  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  51.97 
 
 
295 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  51.97 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  52.44 
 
 
271 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  50.4 
 
 
260 aa  271  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  49.19 
 
 
259 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  47.56 
 
 
259 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  50.99 
 
 
257 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  48.22 
 
 
274 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  48.03 
 
 
255 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  49.18 
 
 
269 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  47.62 
 
 
254 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  48.77 
 
 
254 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  47.58 
 
 
291 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  44.49 
 
 
255 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  45.24 
 
 
255 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7397  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 
290 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
285 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  45.49 
 
 
255 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  45.24 
 
 
276 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  45.34 
 
 
265 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  45.34 
 
 
265 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  44.49 
 
 
261 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  41.84 
 
 
267 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  43.51 
 
 
274 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  45.23 
 
 
255 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 
265 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06304  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
261 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  46.93 
 
 
270 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  45.34 
 
 
277 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
260 aa  222  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
270 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
256 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
270 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  45.61 
 
 
270 aa  221  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.46 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.7 
 
 
271 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.9 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.5 
 
 
625 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0753  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  40.89 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  42.08 
 
 
254 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  45.45 
 
 
290 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
256 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
256 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
256 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  44.35 
 
 
263 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
256 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  43.1 
 
 
268 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 
273 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  42.5 
 
 
269 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
256 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 
256 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  41.77 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  41.77 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
266 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  42.79 
 
 
256 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  44.3 
 
 
271 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
271 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
271 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
271 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  44.3 
 
 
271 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  41.49 
 
 
255 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>