44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01861 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  267  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  96.12 
 
 
129 aa  258  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  72.87 
 
 
184 aa  209  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  69.6 
 
 
128 aa  192  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  61.11 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  60.94 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  57.81 
 
 
128 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  43.65 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  49.09 
 
 
113 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  48.18 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  47.27 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  46.36 
 
 
126 aa  116  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  42.4 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  47.75 
 
 
132 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  44.55 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  44.14 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  43.64 
 
 
126 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  43.64 
 
 
126 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  43.64 
 
 
126 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  43.64 
 
 
126 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  40.52 
 
 
125 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  40.17 
 
 
126 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  44.55 
 
 
116 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  40.52 
 
 
123 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  35.45 
 
 
130 aa  93.6  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  31.5 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  28.45 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  27.19 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  24.07 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  26.17 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  30.49 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  26.32 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  29 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  29 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  29 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  27.91 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  29 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>