45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0293 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  58.4 
 
 
129 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  65.29 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  61.54 
 
 
135 aa  167  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  53.6 
 
 
184 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  53.6 
 
 
128 aa  157  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  49.52 
 
 
113 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  49.52 
 
 
126 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  43.9 
 
 
126 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  48.57 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  44 
 
 
128 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  43.41 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  47.62 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  42.4 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  43.55 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  39.47 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  28.46 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  33.61 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  26.17 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  27.52 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  26.79 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  32.1 
 
 
119 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  31.46 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  24.74 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>