57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2969 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  98.41 
 
 
126 aa  256  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  98.41 
 
 
126 aa  256  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  91.27 
 
 
126 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  89.68 
 
 
126 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  89.68 
 
 
126 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  89.68 
 
 
126 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  89.68 
 
 
126 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  97.35 
 
 
113 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  75.4 
 
 
126 aa  205  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  74.4 
 
 
128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  72.22 
 
 
125 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  73.02 
 
 
123 aa  193  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  66.67 
 
 
132 aa  192  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  70.73 
 
 
128 aa  188  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  69.05 
 
 
150 aa  185  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  49.52 
 
 
130 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  48.18 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  47.27 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  48.04 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  43.7 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  41.35 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  36.27 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  32.2 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  34.52 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  34.62 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  37.35 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  37.35 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  33.64 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  33.65 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  33.65 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  33.65 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  33.65 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  32.69 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  32.69 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  32.69 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  32.69 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  33.63 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  30.48 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  31.43 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  29.13 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  27.43 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  23.47 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  28.85 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  29.81 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  26.74 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  32.53 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  25.58 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  27.35 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  25.49 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  23.3 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  20.93 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  26.67 
 
 
120 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>