58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0845 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  73.02 
 
 		 126 aa  197  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  72.22 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  72.22 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  72.22 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  70.4 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  72.22 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  71.43 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  71.9 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  73.55 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  69.05 
 
 		 126 aa  185  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  69.05 
 
 		 126 aa  185  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  71.07 
 
 		 125 aa  184  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  67.46 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  72.57 
 
 		 113 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  46.4 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  43.65 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  44.8 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  40.16 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  42.28 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  44.04 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  40.2 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  35.58 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  34.48 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  31.4 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  34.96 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  37.35 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  37.35 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  37.35 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  36.14 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  36.14 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  35.37 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  33.73 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  31.4 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  30.49 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  29.47 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  32.53 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  31.4 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  27.88 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  33.01 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  26 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  32 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  32.63 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  21.9 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  27.03 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  33.73 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  24.07 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  29.21 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>