15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2093 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2093  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0050672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  51.06 
 
 
199 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1836  hypothetical protein  46.39 
 
 
197 aa  129  2e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301761  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  49.14 
 
 
198 aa  124  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  44.68 
 
 
195 aa  114  1e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  39.69 
 
 
244 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1703  hypothetical protein  44.28 
 
 
210 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.338855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0301  hypothetical protein  39.78 
 
 
199 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0142  hypothetical protein  39.78 
 
 
199 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1401  hypothetical protein  38.07 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.89013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1332  hypothetical protein  40.85 
 
 
221 aa  88.6  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.386362  normal  0.4731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1413  hypothetical protein  45.22 
 
 
243 aa  78.6  6e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5431e-10 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2029  hypothetical protein  42.44 
 
 
209 aa  76.6  2e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0861085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01170  hypothetical protein  34.8 
 
 
209 aa  64.7  9e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14690  MarR family regulator  36.5 
 
 
205 aa  62  5e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>