30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0039 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 
52 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 
52 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  92.31 
 
 
52 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  90.38 
 
 
52 aa  100  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  70 
 
 
61 aa  77.4  6e-14  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  69.57 
 
 
61 aa  75.1  3e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  66 
 
 
61 aa  70.5  7e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  66 
 
 
63 aa  69.7  1e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  59.18 
 
 
62 aa  65.5  2e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
64 aa  64.3  5e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
64 aa  64.3  5e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  53.06 
 
 
64 aa  63.5  9e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  53.06 
 
 
64 aa  62.4  2e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  58.82 
 
 
56 aa  62  2e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
57 aa  57.8  5e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  59.18 
 
 
60 aa  57.4  7e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
60 aa  57.4  7e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  54.9 
 
 
56 aa  56.6  1e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  50.98 
 
 
60 aa  55.5  2e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  52.08 
 
 
58 aa  53.5  9e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
56 aa  53.5  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  52.08 
 
 
58 aa  52.4  2e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
60 aa  51.6  4e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  50 
 
 
58 aa  50.8  6e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  50 
 
 
57 aa  50.1  1e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  53.85 
 
 
55 aa  50.1  1e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  54.9 
 
 
55 aa  49.7  1e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  54.9 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  47.06 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  46 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.973212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>