78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2186 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2186  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  100 
 
 
359 aa  751    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1654  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  77.84 
 
 
360 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2484  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  75.92 
 
 
356 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0824603  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1952  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  73.3 
 
 
362 aa  566  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.585663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2157  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  61.32 
 
 
357 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0030  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  60.63 
 
 
359 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2320  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  59.05 
 
 
359 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00941255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0129  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  58.77 
 
 
359 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1856  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  58.22 
 
 
359 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00101342  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0695  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  58.77 
 
 
359 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.035571  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1955  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  57.38 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.005699  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0037  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  58.77 
 
 
359 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0242217  normal  0.0801222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4043  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  47.43 
 
 
366 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3186  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  43.37 
 
 
354 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00847169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2093  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  46.57 
 
 
394 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0253  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  43.27 
 
 
352 aa  322  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0245  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  44.01 
 
 
399 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.199901  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1600  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  42.17 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000981714  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2294  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  44.63 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0920  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  44.63 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2670  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  41.94 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0080  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  41.6 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.580502  hitchhiker  0.00395825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2200  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  42.17 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2531  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  42.09 
 
 
381 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576489  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0527  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  43.79 
 
 
381 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1554  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  42.09 
 
 
381 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.815506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0280  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  41.34 
 
 
386 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0483706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0854  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  32.33 
 
 
410 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0908  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  32.53 
 
 
377 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0170  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  32.23 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1445  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  30.09 
 
 
385 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0345  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  32.23 
 
 
378 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0163541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1456  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  30.7 
 
 
366 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1212  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  32.16 
 
 
371 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1224  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  30 
 
 
385 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1629  hydrogensulfite reductase  30.03 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.501606  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1630  hydrogensulfite reductase  25.09 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1653  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.66 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.625307  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.82 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  24.26 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2185  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  20.65 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.894109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1562  sulfite reductase, beta subunit  24.91 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.29 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1781  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.14 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1369  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.92 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.105781  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1951  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.66 
 
 
419 aa  62.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.770019  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0344  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  22.91 
 
 
412 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0167672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.1 
 
 
287 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.86 
 
 
290 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0171  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  22.6 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.21 
 
 
290 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2156  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  19.93 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0732  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.63 
 
 
291 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344007  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2218  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  22.99 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.92 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2485  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  20.47 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0564556  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0252  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.74 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2321  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  20.29 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  22.64 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1446  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.9 
 
 
414 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.11 
 
 
301 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1309  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.5 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.28628  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.09 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0347931  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1457  hydrogensulfite reductase  22.81 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0036  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  18.84 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000030158  normal  0.0400699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0526  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  21.88 
 
 
437 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0907  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  22.55 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0694  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  18.84 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000114169  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.37 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.78 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2201  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  20.62 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0128  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  19.57 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.429843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.47 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2094  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  19.59 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4042  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  19.66 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  22.39 
 
 
639 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1857  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  20.22 
 
 
408 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105958  normal  0.0849818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0562  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
101 aa  42.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.713646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>