28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1212 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  100 
 
 		 158 aa  320  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  31.54 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  31.58 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  30.83 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2685  FlgN  29.3 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.742379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  29.73 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  31.58 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  29.41 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  29.75 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  31.85 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1173  FlgN family protein  24.82 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  31.11 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  30.08 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0525  FlgN family protein  29.34 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  30.88 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  29.92 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  28.97 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  28.97 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  28.97 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  28.97 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  28.44 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  28.04 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  28.04 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  25.56 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  28.04 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23970  Flagella synthesis protein  30.3 
 
 		 149 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3797  FlgN family protein  28.87 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0888  FlgN family protein  27.41 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0650773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>