22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1141 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  256  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  48.8 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  48.8 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  46.4 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  46.4 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  37.9 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1808  hypothetical protein  28.46 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00352059  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  36.46 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  31.93 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  36.08 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  27.64 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  28.04 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  28.04 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  30.25 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  27.59 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  27.91 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  28.42 
 
 		 133 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>