299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0060 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0044  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0908576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  98.08 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  98.08 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4715  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4714  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000434164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2159  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000010146  hitchhiker  0.000000000399675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0022  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2616  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.256373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4279  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.4241200000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0023  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000537949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0100  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000550184  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0055  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00145932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t23  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R65  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4771  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0774418  normal  0.0477012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.1159899999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0026  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0024  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0027  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4772  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0349282  normal  0.0463212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0024  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000696404  hitchhiker  0.000000493359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0050  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0992  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.34498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0050  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4954  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000153884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4713  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000628105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0042  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0706  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0099  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000502602  hitchhiker  0.0000112339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4636  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000617917  normal  0.102645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0045  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4280  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000230122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2055  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000108601  hitchhiker  0.000600208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0080  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.8513  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000507488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4634  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000734065  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1272  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000331558  hitchhiker  0.00050925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>