More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2226 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
114 aa  233  5e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  4.57155e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  67.96 
 
 
105 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.09 
 
 
109 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  66.04 
 
 
110 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.29 
 
 
106 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  68 
 
 
111 aa  138  2e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.36 
 
 
117 aa  126  1e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  60.78 
 
 
121 aa  118  2e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.44 
 
 
113 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.29 
 
 
119 aa  115  2e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  2.12185e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.33 
 
 
118 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5152  Rieske (2Fe-2S) domain protein  54 
 
 
108 aa  107  7e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.17 
 
 
114 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.04578e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  52.58 
 
 
125 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.04 
 
 
116 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46 
 
 
114 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.66 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21930  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  51.02 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  43.56 
 
 
119 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.48 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  45.74 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  46.24 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  51 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.74 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.74 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.24 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.68 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  44.68 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.68 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.56 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  42.45 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.69 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0562  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.46 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  43.62 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.33 
 
 
113 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41.44 
 
 
112 aa  82.8  1e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41.9 
 
 
122 aa  82.4  2e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.59 
 
 
109 aa  81.6  3e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.51 
 
 
114 aa  81.3  5e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  39 
 
 
106 aa  80.5  8e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1359  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.09 
 
 
116 aa  80.1  1e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  37.74 
 
 
107 aa  79.3  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.58 
 
 
100 aa  78.2  3e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  36.54 
 
 
238 aa  78.2  4e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.61 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  39 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.27 
 
 
104 aa  76.6  9e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.11 
 
 
101 aa  76.3  1e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  41.24 
 
 
124 aa  76.6  1e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  37.37 
 
 
102 aa  76.3  1e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.62 
 
 
116 aa  75.5  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
105 aa  75.9  2e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
104 aa  75.9  2e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.506336  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  43 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4109  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  45.98 
 
 
112 aa  76.3  2e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.61 
 
 
105 aa  75.5  2e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  38.38 
 
 
103 aa  75.1  3e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
118 aa  73.9  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  39 
 
 
109 aa  73.9  7e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  37.76 
 
 
106 aa  72.8  1e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.62 
 
 
106 aa  72.4  2e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.37 
 
 
137 aa  72.8  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.62 
 
 
106 aa  72.4  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.6 
 
 
101 aa  72  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.14 
 
 
350 aa  71.6  3e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.62 
 
 
294 aa  71.2  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.96 
 
 
105 aa  70.5  7e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  37.89 
 
 
110 aa  70.5  8e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
133 aa  70.1  9e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
105 aa  70.1  9e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 
109 aa  69.7  1e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.46 
 
 
526 aa  69.7  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  35.05 
 
 
106 aa  69.3  1e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
106 aa  69.7  1e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  33.33 
 
 
102 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
322 aa  68.9  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0406  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.08 
 
 
103 aa  68.9  2e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
107 aa  69.3  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4417  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.05 
 
 
127 aa  68.6  3e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122745  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.54 
 
 
506 aa  68.6  3e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.64 
 
 
120 aa  67.8  5e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2913  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.18 
 
 
163 aa  67.4  6e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  34 
 
 
101 aa  67.4  6e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
102 aa  67.4  6e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
104 aa  67.4  6e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>