23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1244 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  93.44 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  77.6 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  77.6 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  46.4 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  44.8 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  49.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  36.05 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  33.06 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  31.36 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  29.66 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2712  hypothetical protein  33.06 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.548763  unclonable  0.0000000000219887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3114  hypothetical protein  33.06 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  40.23 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  30.95 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  44.83 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  44.83 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  35.04 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1808  hypothetical protein  21.95 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00352059  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  31.71 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  28.1 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>